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La institución que dirige la práctica del microfútbol es la Asociación Mundial de Fútsal (AMF) mientras que la FIFA (Federación Internacional de Fútbol Asociado) es la encargada de regir el fútbol sala.
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En el microfútbol los partidos tienen una duración de 40 minutos (dos períodos de 20 minutos y un descanso de 10 minutos) en el fútbol sala la duración del encuentro es la misma, pero el período de descanso es de 15 minutos.
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En el microfútbol el saque lateral y de esquina se realiza con las manos, mientras que en el fútbol sala se lleva a cabo con los pies.
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En el microfútbol el arquero no puede pasar la mitad de la cancha, a diferencia del fútbol sala en donde el portero puede salir a jugar en la zona contraria.
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En el microfútbol el saque del arquero no puede superar la mitad de la cancha, en el fútbol sala sí puede pasar la línea de la mitad.
En Colombia se conoce como microfútbol y estas son las diferencias con el fútbol sala:
